随着上一季的结束，Castor克隆人不再构成威胁，克隆人姐妹们的生活似乎可以回归安静，但孕育于过往的险境出现了：一个名为Neolution的组织一直在牵动Leda、Castor、Dyad 和 Topside的命运。在离开冰岛安全屋后，Sarah遇到了神秘的新盟友，而这个人与这一切的开端有着密不成分的联系——Beth Childs。在黑客 Dizzy 的帮手下，Sarah不得不跟随 Beth的脚步，慢慢走向强大的新敌人。Sarah的家人安全受到威胁，她承受着巨大的压力，与此同时，克隆人姐妹们正在被分开推往不同的标的目的。为了在这次考验中幸存下来，她们必需比此前任何时候都更团结一致。